Dépistage rapide
Une découverte réalisée au Département de chimie pourrait bouleverser le marché des tests diagnostiques qui font intervenir l'ADN ou les protéines.
Par Jean Hamann
Un an après avoir annoncé la mise au point d’une méthode rapide, peu coûteuse et pratique de détection de séquences d’ADN, une équipe du Département de chimie publie coup sur coup deux articles montrant que cette méthode peut également servir à détecter la présence de protéines et qu’elle est transférable sur micropuces. Les chercheurs Maïté Béra Abérem, Ahmed Najari, Hoang-Anh Ho, Jean-François Gravel, Philippe Nobert, Denis Boudreau et Mario Leclerc en font la démonstration dans de récentes éditions des revues scientifiques Advanced Materials et Analytical Chemistry.
Nommée Fluorescence Chain Reaction (FCR) ou superallumage, la méthode mise au point par cette équipe pourrait bouleverser le marché des tests de détection d’ADN et des protéines. Le principal avantage du superallumage sur les méthodes existantes est qu’il ne nécessite pas de traitements complexes de purification, d’amplification et d’extraction des molécules à analyser. «Pour les protéines, on espère en arriver à utiliser directement une goutte de sang, de salive ou d’urine, dit Mario Leclerc. En théorie, il suffit qu’il y ait quelques molécules d’ADN ou de la protéine recherchée pour que notre test fonctionne.»
Appâter le virus
Le superallumage permet de confirmer la présence de molécules propres à une espèce microbienne, à une maladie ou à un état physiologique. La première étape du test consiste à créer un segment d’ADN complémentaire à la molécule recherchée. Par exemple, pour diagnostiquer la présence du virus de l’herpès, il faut que le test soit «appâté» avec une séquence d’ADN qui «reconnaît» un gène ou une protéine propre à cette espèce. Ce brin d’ADN est ensuite apparié à un polymère coloré.
La sonde ainsi formée est ensuite mise en présence de l’échantillon à analyser. Lorsque cet échantillon contient la séquence d’ADN ou la protéine recherchée, il y a appariement avec la sonde, ce qui en modifie la structure tridimensionnelle et les propriétés optiques: l’ensemble devient fluorescent. Toute l’opération permet de confirmer en quelques heures un diagnostic de grippe aviaire, par exemple, comparativement à trois jours avec la méthode actuelle.
Autre nouveauté, la sonde formée par le polymère et la séquence d’ADN complémentaire peut être déposée à sec sur une plaque de verre, ce qui ouvre la voie à la fabrication de micropuces permettant de réaliser des tests simultanés. «C’est comme si, au lieu de ne poser qu’une question à la fois, on pouvait en poser 100, explique Mario Leclerc. Notre méthode laisse présager une démocratisation des tests de dépistage d’ADN et de protéines, un peu comme l’ont fait les tests de grossesse maison.»
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Nommée Fluorescence Chain Reaction (FCR) ou superallumage, la méthode mise au point par cette équipe pourrait bouleverser le marché des tests de détection d’ADN et des protéines. Le principal avantage du superallumage sur les méthodes existantes est qu’il ne nécessite pas de traitements complexes de purification, d’amplification et d’extraction des molécules à analyser. «Pour les protéines, on espère en arriver à utiliser directement une goutte de sang, de salive ou d’urine, dit Mario Leclerc. En théorie, il suffit qu’il y ait quelques molécules d’ADN ou de la protéine recherchée pour que notre test fonctionne.»
Appâter le virus
Le superallumage permet de confirmer la présence de molécules propres à une espèce microbienne, à une maladie ou à un état physiologique. La première étape du test consiste à créer un segment d’ADN complémentaire à la molécule recherchée. Par exemple, pour diagnostiquer la présence du virus de l’herpès, il faut que le test soit «appâté» avec une séquence d’ADN qui «reconnaît» un gène ou une protéine propre à cette espèce. Ce brin d’ADN est ensuite apparié à un polymère coloré.
La sonde ainsi formée est ensuite mise en présence de l’échantillon à analyser. Lorsque cet échantillon contient la séquence d’ADN ou la protéine recherchée, il y a appariement avec la sonde, ce qui en modifie la structure tridimensionnelle et les propriétés optiques: l’ensemble devient fluorescent. Toute l’opération permet de confirmer en quelques heures un diagnostic de grippe aviaire, par exemple, comparativement à trois jours avec la méthode actuelle.
Autre nouveauté, la sonde formée par le polymère et la séquence d’ADN complémentaire peut être déposée à sec sur une plaque de verre, ce qui ouvre la voie à la fabrication de micropuces permettant de réaliser des tests simultanés. «C’est comme si, au lieu de ne poser qu’une question à la fois, on pouvait en poser 100, explique Mario Leclerc. Notre méthode laisse présager une démocratisation des tests de dépistage d’ADN et de protéines, un peu comme l’ont fait les tests de grossesse maison.»
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